Целью деятельности комитета является реализация на территории Томской области полномочий Российской Федерации в сфере образования, переданных Департаменту общего образования Томской области.

Задачами деятельности комитета являются исполнение целей, задач и функций Департамента по:

1. обеспечению соблюдения действующего законодательства в сфере образования организациями, осуществляющими образовательную деятельность на территории Томской области (за исключением организаций, государственный контроль (надзор) в отношении которых отнесен законодательством к полномочиям федеральных органов государственной власти в сфере образования), а также органами местного самоуправления муниципальных образований Томской области, осуществляющими управление в сфере образования на соответствующей территории; 
2. обеспечению соблюдения лицензионных требований и условий организациями, осуществляющими образовательную деятельность на территории Томской области (за исключением организаций, лицензирование образовательной деятельности которых отнесено законодательством к полномочиям федеральных органов государственной власти в сфере образования);
3. обеспечению соответствия качества образования требованиям федеральных государственных образовательных стандартов в организациях, осуществляющих образовательную деятельность по имеющим государственную аккредитацию образовательным программам на территории Томской области (за исключением организаций, федеральный государственный контроль качества в отношении которых отнесен законодательством к полномочиям федеральных органов государственной власти в сфере образования);
4. предоставлению государственных услуг  в рамках исполнения переданных полномочий; 
5. защите прав граждан, предусмотренных законодательством об образовании;
6. профилактике нарушений организациями, осуществляющими образовательную деятельность, обязательных требований